吴继科，1942年9月出生于连云港徐圩盐场。

1961年7月参加中国人民解放军，

1963年9月加入中国共产党。历任陆军第60军步兵第179师537团战士、班长、排长、司令部作训参谋。

1966年7月调南京军区司令部工作，历任办公室秘书、副科长，军训部科长、副部长，办公室主任等职。

1990年9月至1996年2月，先后任陆军第1集团军步兵3师师长，陆军第12集团军参谋长、副军长。

1996年3月任南京军区副参谋长，

1997年3月至2002年10月，任南京军区后（联）勤部部长、党委书记，军区党委常委。

1994年7月被授予少将军衔，是第九届全国人民代表大会代表。